Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SETD2Q9BYW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SETD2Q9BYW2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms