Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC2Q9BYS8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC2Q9BYS8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms