Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK3Q9BYB0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms