Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRIP1Q9BX63 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms