Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms