Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106CQ9BVX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms