Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF4Q9BUZ4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms