Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms