Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms