Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM79Q9BSE2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms