Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms