Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SMIM7Q9BQ49 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM7Q9BQ49 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM7Q9BQ49 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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