Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF11Q99590 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF11Q99590 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF11Q99590 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF11Q99590 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF11Q99590 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCAF11Q99590 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCAF11Q99590 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCAF11Q99590 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms