Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms