Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIRT1Q96EB6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRT1Q96EB6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms