Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM5Q96DZ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms