Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC59Q96AG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC59Q96AG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms