Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS3Q969F9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms