Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms