Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUPT20HQ8NEM7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms