Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms