Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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