Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC2Q8N394 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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