Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms