Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms