Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYCP3Q8IZU3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms