Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF2Q8IX21 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms