Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC83Q8IWF9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms