Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms