Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALYREFQ86V81 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALYREFQ86V81 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms