Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2Q1Q7Z7E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms