Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms