Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP50Q70EL3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms