Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS13CQ709C8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms