Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD109Q6YHK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms