Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms