Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S2Q6QNY1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms