Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms