Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms