Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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