Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL2Q6F5E8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms