Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms