Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM164Q5U3C3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms