Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A3Q5K4L6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms