Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHC1Q5JVL4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms