Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms