Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSMPQ1L6U9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSMPQ1L6U9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms