Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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GEN1Q17RS7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GEN1Q17RS7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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