Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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CTF1Q16619 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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CTF1Q16619 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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