Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDB1Q16531 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms